Proteomics and RNA-seq datasets associated with: “Tamoxifen mechanically reprograms the tumor microenvironment via HIF-1A and reduces cancer cell survival”

Versión 1.0

Del Rio Hernandez, Armando; Cortes Lopez, Jose Ernesto; Lachowski, Dariusz; Robinson, Benjamin; Sarper, Muge; Teppo, Jaakko Sakari; Thorpe, Stephen; Lieberthal, Tyler; Iwamoto, Kazunari; Lee, David; Okada-Hatakeyama, Mariko; Varjosalo, Markku, 2026, "Proteomics and RNA-seq datasets associated with: “Tamoxifen mechanically reprograms the tumor microenvironment via HIF-1A and reduces cancer cell survival”", https://doi.org/10.21950/OCCIBS, e-cienciaDatos, V1

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Descripción	The project investigates how tamoxifen modulates the tumor microenvironment through mechanobiological changes involving HIF-1A, and how these changes influence cancer cell survival. The study integrates proteomics and RNA sequencing (RNA-seq) as described in the associated publication. Proteomics analysis data deposited in PeptideAtlas under reference PASS01070. PSCs RNA sequencing (RNA-seq) data deposited in the European Nucleotide Archive (ENA) under accession ERP023834. This e-cienciaDatos entry is intended to provide institutional Open Access traceability by referencing the original repositories.
Materia	Ciencias médicas, de la salud y de la vida
Palabra clave	tamoxifen, mechanobiology, tumor microenvironment, HIF-1A, cancer cell survival, proteomics, mass spectrometry, RNA-seq, PSCs, EMBO Reports
Publicación relacionada	IsSupplementTo: Cortes, E., Lachowski, D., Robinson, B., Sarper, M., Teppo, J. S., Thorpe, S. D., Lieberthal, T. J., Iwamoto, K., Lee, D. A., Okada-Hatakeyama, M., Varjosalo, M. T., & Del Río Hernández, A. E. (2019). Tamoxifen mechanically reprograms the tumor microenvironment via HIF-1A and reduces cancer cell survival. EMBO Reports, 20(1), e46557. https://doi.org/10.15252/embr.201846557handle: 10016/49311
Notas	Data availability statements and identifiers are provided in the associated publication. Some PeptideAtlas datasets may require file transfer access (e.g., FTP or repository-specific download methods). For time-sensitive administrative needs, a minimal e-cienciaDatos record can be created to mint a DOI while full metadata and file handling are completed subsequently.
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Metadatos de cita

ID persistente	doi:10.21950/OCCIBS
Fecha de publicación	2026-02-24
Título	Proteomics and RNA-seq datasets associated with: “Tamoxifen mechanically reprograms the tumor microenvironment via HIF-1A and reduces cancer cell survival”
Autor	https://ror.org/03ths8210https://orcid.org/0000-0001-5062-8910 https://ror.org/041kmwe10https://orcid.org/0000-0001-6106-1323 https://ror.org/041kmwe10https://orcid.org/0000-0003-1194-8019 https://ror.org/041kmwe10https://orcid.org/0000-0003-3968-6583 https://ror.org/041kmwe10https://orcid.org/0000-0003-3864-6651 https://ror.org/040af2s02https://orcid.org/0000-0003-1022-5572 https://ror.org/026zzn846https://orcid.org/0000-0002-4707-7756 https://ror.org/041kmwe10https://orcid.org/0000-0002-3250-8162 https://ror.org/035t8zc32https://orcid.org/0000-0001-9794-9420 https://ror.org/026zzn846https://orcid.org/0000-0001-7646-4643 Okada-Hatakeyama, Marikohttps://ror.org/035t8zc32 https://ror.org/040af2s02https://orcid.org/0000-0002-1340-9732
Contacto	Utilice el botón de e-mail de arriba para contactar. Río Hernández, Armando del (Universidad Carlos III de Madrid)
Descripción	The project investigates how tamoxifen modulates the tumor microenvironment through mechanobiological changes involving HIF-1A, and how these changes influence cancer cell survival. The study integrates proteomics and RNA sequencing (RNA-seq) as described in the associated publication. Proteomics analysis data deposited in PeptideAtlas under reference PASS01070. PSCs RNA sequencing (RNA-seq) data deposited in the European Nucleotide Archive (ENA) under accession ERP023834. This e-cienciaDatos entry is intended to provide institutional Open Access traceability by referencing the original repositories.
Materia	Ciencias médicas, de la salud y de la vida
Palabra clave	tamoxifen mechanobiology tumor microenvironment HIF-1A cancer cell survival proteomics mass spectrometry RNA-seq PSCs EMBO Reports
Publicación relacionada	IsSupplementTo: Cortes, E., Lachowski, D., Robinson, B., Sarper, M., Teppo, J. S., Thorpe, S. D., Lieberthal, T. J., Iwamoto, K., Lee, D. A., Okada-Hatakeyama, M., Varjosalo, M. T., & Del Río Hernández, A. E. (2019). Tamoxifen mechanically reprograms the tumor microenvironment via HIF-1A and reduces cancer cell survival. EMBO Reports, 20(1), e46557. https://doi.org/10.15252/embr.201846557 handle 10016/49311 https://hdl.handle.net/10016/49311
Notas	Data availability statements and identifiers are provided in the associated publication. Some PeptideAtlas datasets may require file transfer access (e.g., FTP or repository-specific download methods). For time-sensitive administrative needs, a minimal e-cienciaDatos record can be created to mint a DOI while full metadata and file handling are completed subsequently.
Idioma	Inglés
Información de la subvención	European Research Council: ERC 282901 (ForceRegulation) Biotechnology and Biological Sciences Research Council: BB/N018532/1 Osaka University: ICR2-17-01 JSPS KAKENHI: 15KT0084
Depositante	Río Hernández, Armando del
Fecha de depósito	2026-02-16
Dataset relacionado	PeptideAtlas: PASS01070 (proteomics dataset); European Nucleotide Archive (ENA): ERP023834 (PSCs RNA-seq dataset)

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